杨路，黄河学者，校聘教授

研究方向

利用基于质谱的蛋白质组学和代谢组学技术结合传统分子生物学方法，从新的角度对传统实验方法难以研究的生物学问题进行探索。

教育和工作经历

2022年7月-现在河南大学，中国，黄河学者，校聘教授

代谢&质谱

合作导师：林圣彩中国科学院院士

2020年9月-2022年7月中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,上海,中国

博士后,生殖&重编程

导师：徐国良中国科学院院士

2019年4月-2020年3月芝加哥大学,芝加哥,美国

博士后,蛋白质谱&免疫导师：赵英明教授

2012年9月-2018年12月生物与化学交叉中心，上海有机所，上海，中国

中国科学院大学,中国

博士，蛋白质质谱&细胞生物学导师：张耀阳研究员

2008年9月–2012年7月广东医科大学,东莞,中国

本科，药学

已发表文章

1.LuYang*,Zaijun Ma*,HanWang,KongyanNiu,YeCao,LeSun,Yang Geng,BoYang, FengGao,Zuolong Chen,ZhenWu,QingqingLi,Yong Shen,XuminZhang,Hong Jiang, Yelin Chen, RuiLiu, Nan Liu, Yaoyang Zhang (2019) Ubiquitylome study identifies increased histone 2A ubiquitylation as an evolutionarily conserved aging biomarker.Nature Communications.May 21;10(1):2191. (*Co-first author)

2.Lu Yang*, Ye Cao*, Jin Zhao, Yanshan Fang, Nan Liu, Yaoyang Zhang (2019) MultidimensionalProteomicsIdentifiesDeclinesinProteinHomeostasisandMitochondria as Early Signals for NormalAgingand Age-associatedDisease inDrosophila.Molecular & Cellular Proteomics. Oct;18(10):2078-2088. (*Co-first author)

3.QiangHuang*,LuYang*,JiLuo*, ZhiyuanWang,XiangyunYang,WenhaiJin,Yanshan Fang,JuanyingYe,BingShan,Yaoyang Zhang (2015)SWATHenablespreciselabel‐free quantification on proteome scale.Proteomics. Apr;15(7):1215-23. (*Co-first author)

4.YiFang,XiaojiangXu,JunDing,LuYang,MaryTDoan,Peer WFKarmaus,Nathaniel

WSnyder,Yingming Zhao,Jian-Liang Li,Xiaoling Li(2021) Histone crotonylation promotes mesoendodermal commitment of humanembryonicstem cells.Cell StemCell. Apr1;28(4):748-763.e7.

5.Carlos Moreno-Yruela, Di Zhang, WeiWei, Michael Bæk,Wenchao Liu,Jinjun Gao, Daniela Danková,AlexanderL. Nielsen,Julie E. Bolding,LuYang, SamuelT. Jameson, Jiemin Wong, ChristianA. Olsen, Yingming Zhao (2022)Class I Histone Deacetylases (HDAC1‒3) are Histone Lysine Delactylases.Science advance. Jan 21;8(3):eabi6696

6.KyleDelaney,MinjiaTan,ZhesiZhu,JinjunGao,LunzhiDai,SunjooKim,JunDing,MaomaoHe,LevonHalabelian,LuYang,PrabakaranNagarajan,MarkRobertParthun,Sangkyu Lee,Saadi Khochbin, Yujun George Zheng,Yingming Zhao(2021) Histone lysine methacrylation is adynamic post-translational modification regulated by HAT and SIRT2.Cell Discovery. Dec 28;7(1):12

已获得基金

中国科学院特别研究助理，60万上海市超级博士后，30万

科研经历

河南大学，黄河学者，校聘教授合作导师:林圣彩中国科学院院士

◆研究葡萄糖饥饿后，碳源转换的机制

§利用蛋白质组学的研究方法，在细胞和小鼠模型中研究，葡萄糖饥饿后，哪些蛋白质降解成氨基酸以提供能量

§利用传统分子生物学方法研究蛋白质降解供能的机制

§研究该碳源转换机制在衰老过程中发挥的作用

生物与化学与细胞生物学研究所，中国科学院大学，中国导师:徐国良中国科学院院士

◆使终末分化的生殖细胞进入细胞周期

§建立在小鼠体内，使终末分化的生殖细胞中表达外源蛋白质的方法。找到过去10年中未能在终末分化的生殖细胞中表达外源蛋白质的原因

§建立体外，终末分化的生殖细胞中表达外源蛋白质的方法

§建立功能性筛选系统，以寻找或验证使终末分化生殖细胞进入细胞周期的细胞因子

BenMay癌症研究中心，芝加哥大学，美国导师：赵英明教授

◆寻找去除蛋白质乳酸化修饰的酶(ScienceAdvance)

§通过体外酶活实验发现HDAC1-3是去除蛋白质乳酸化修饰的酶

◆研究多种模式生物中的新型蛋白质翻译后修饰

§使用质谱的方法，定量研究老鼠组织，哺乳动物细胞系和原代神经元中蛋白质的乳酸化修饰在多种小分子刺激以及疾病状态下的变化

◆为合作者分析测试蛋白质组学样品(CellStemCell)

§使用蛋白质组学方法分析合作实验室的生物样品

◆维护QExactive

§维护QExactive质谱仪

生物与化学交叉中心，中国科学院大学，中国导师:张耀阳研究员

◆项目一：泛素化蛋白质组学研究发现进化保守的调控衰老的表观遗传标志物

(NatureCommunications)

§稳定同位素标记策略发现长寿蛋白质

§泛素化修饰在较老蛋白质中的比例比在新蛋白质中的比例更高

§ubH2A是一个进化上保守的调控衰老的表观遗传标志物

§降低ubH2A水平促进果蝇健康寿命的延长

◆项目二：多维度定量蛋白质组学发现果蝇衰老过程中线粒体的失调(Molecular & CellularProteomics)

§果蝇衰老过程中多组织的定量蛋白质组学研究

§果蝇衰老过程中蛋白质组学的功能性分析

§果蝇衰老过程中蛋白质合成速率降低

§蛋白质合成受多层因素的调控

§Pink1突变果蝇在衰老早期出现蛋白质合成速率的严重失调

◆项目三:SWATH在总蛋白组水平上准确进行非标记定量(Proteomics)

§SWATH定量蛋白质组有高可重复性

§SWATH可以准确定量蛋白质含量

§高浓度上样量有明显的信号抑制现象